溴化丙锭PI使用方法

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简 介
Propidium iodide(溴化丙锭,以下简称PI)几乎无序列偏好性的通过嵌入碱基对而结合DNA。一般而言,一个染料分子结合4-5个碱基对。但同时PI也可以与RNA结合,这就需要使用核酸酶处理,以区分DNA和RNA染色。PI一旦与核酸结合,其荧光即增强20到30倍,其荧光激发波长改变约~30–40nm而为红色,发射波长改变约15nm为蓝色。虽然其摩尔吸光系数(消光系数)相对较低,若使用合适的光学过滤器,PI表现出一个足够大的Stokes位移能够允许同时检测核DNA和荧光标记抗体。

PI可以用荧光显微镜,激光扫描共聚焦显微镜,流式细胞仪和荧光计进行检测。

PI可以穿透细胞膜,通常不能通过活细胞细胞膜。PI常用于鉴定死细胞,同时也作为一个复染剂用于多色荧光技术。

PI荧光光谱特性
当PI与核酸结合,其荧光最大激发波长为535nm,最大发射波长为
617nm(见图1)。PI可被氙气或汞弧灯或与氩离子激光器的488激
光所激发。通常情况下,PI在流式细胞仪的FL2通道检测

图 1 PI结合双链DNA后的荧光激发和发射波长
实验材料及方法

1、复染贴壁细胞用于荧光显微镜
1.1 实验材料
⇒ 荧光显微镜

⇒ 2X SSC

⇒ 无DNA酶的RNA酶

⇒ 抗淬灭剂,如SlowFade® Gold (S36936) 或ProLong® Gold (P36930)抗淬灭剂

1.2 样品制备
⇒ 使用适合您样品的固定步骤。其他染色后,进行PI染色。需要注意的是PI复染需要细胞膜通透。

1.3 RNA酶处理
若样品经多聚甲醛,甲醛或戊二醛固定,需要经RNA酶处理;若样品经甲醇乙酸或丙酮处理,即不需要RNA酶处理。

⇒ 样品使用2X SSC(0.3 M NaCl,0.03 M 柠檬酸钠,pH 7.0)短暂平衡。

⇒ 样品在含100μg/ml 无DNA酶的RNA酶的 2X SSC 中孵育 20min, 37℃。

⇒ 使用2X SSC润洗样品三次,每次1min。

1.4 复染
⇒ 使用2X SSC 平衡样品。

⇒ 使用2X SSC 将1mg/ml(1.5M)PI储液 1:3000 稀释为500nM,通常约300μl足够一个盖玻片染色。使用稀释后的染液覆盖细胞,孵育
1-5min。

⇒ 使用2X SSC润洗样品几次。小心吸干玻片上多余的缓冲液,加入适量的抗淬灭剂如Molecular Probes SlowFade® Gold antifade reagent (S36936) 或 ProLong® Gold antifade
reagent (P36930)。

⇒ 1.4.4 使用荧光显微镜观察样品。

2、复染悬浮细胞用于流式细胞仪
2.1 实验材料
⇒ 流式细胞仪

⇒ PBS

⇒ 乙醇

⇒ Tris 染色缓冲液(见步骤2.3.1)

2.2 样本制备
使用适合于样品的固定方法,或者使用如下步骤。

⇒ 收集2 × 10^5-1 × 10^6个细胞,离心,弃去上清,轻弹管底以用残余液体重悬细胞,加入1ml PBS(室温)。

⇒ 将细胞悬液缓慢转移至4ml高速震荡的无水乙醇(-20℃)中,孵育5-15min(-20℃)。

⇒ 离心,弃去乙醇,轻弹管子,加入5ml PBS(室温),使细胞水合15min。

2.3复染
⇒ 使用染色缓冲液(100 mM Tris, pH 7.4, 150 mM NaCl, 1 mM CaCl2, 0.5 mM MgCl2, 0.1% Nonidet P-40)1:500稀释1 mg/mL (1.5 mM)的PI储液为3 μM溶液,每个样品需1ml。

⇒ 步骤2.2.3的样品离心,弃去上清,轻弹管底,加入1ml PI溶液,室温,孵育15min,然后在流式细胞仪上分析(在染液存在情况下)。如果要使用荧光显微镜观察,需离心,弃去上清,使用新鲜的缓冲液重悬细胞。取一滴细胞悬液于玻片,盖上盖玻片,使用合适的滤光片观察。

3、复染样品用于染色体荧光原位杂交技术(以下称染色体FISH)
3.1 实验材料
⇒ 荧光显微镜

⇒ dH2O

⇒ PBS

⇒ RNA酶

⇒ 抗淬灭剂(可选)

3.2 样品制备
⇒ 根据标准步骤制备样品(见参考文献3,4)。在复染之前,使用去离子水暂短润洗样品,去除残余的盐缓冲液。空气干燥。最后的润洗对于降低非特异性结合有很大帮助。

3.3 复染
⇒ 使用PBS 1:1000稀释1 mg/mL (1.5 mM)的PI储液为1.5μM的染色溶液。吸取300μL的染色溶液直接加入样品。如果必要,加入终浓度为10μg/ml的Rnase A(新鲜配制)。使用塑料盖玻片使染液均匀分布。

⇒ 室温,避光孵育30min,或者37℃避光孵育(如加入RNase)。

⇒ 去除盖玻片,使用PBS或去离子水润洗,洗去未结合的染料。

⇒ 用吸水纸小心洗去样品周围残余的液体。盖上玻璃盖玻片,石蜡封片。另外,也可以根据操作手册,加入适量的抗淬灭剂。

⇒ 使用荧光显微镜观察细胞。

参考文献
1. J Mol Biol 13, 269 (1965);

2. Methods Cell Biol 30, 417 (1989);

3. Methods Enzymol 168, 741 (1989);

4. Pardue, M.L. in Nucleic Acid Hybridization, A Practical Approach, B.D. Hames and S.J. Higgins, Eds., IRL Press, Oxford, England
(1985).