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作者:罗氏官网 发布日期:2015-04-06 10:00
High Pure FFPET DNA Isolation Kit基于离心柱法的抽提原理,免去DNA沉淀和有机试剂抽提的步骤,是快速核酸抽提的理想工具。
?整个抽提过程仅需3小时(含脱蜡过程);
?获得高DNA得率和质量;
?在qPCR,芯片分析和测序等下游应用中获得强大信号。
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图1:从FFPET样本中获得高得率的DNA
柱形图显示了从3种不同乳腺癌或结肠癌异种移植组织的 5um FFPET组织切片 样品中获得的DNA平均得率。通常来说,在不同组织切片的样品个体间存在一 定的DNA得率变异
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图2:从样品中抽提获得高质量DNA,适用于多种下游应用。在HT29异种移植FFPET样本中抽提获得DNA,再进行100,200,300,400bp片段长度扩增子的多重PCR。泳道1和2:使用二甲苯进行脱蜡泳道3和4:使用十六烷进行脱蜡泳道5和6:多重PCR质控对照,核酸样品为人全血中抽提的完整基因组DNA图2:从近期和长期保存的FFPET样品中均可抽提获得高RNA得率 |
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结果:所有泳道中均出现4个清晰的目标条带,表明High Pure FFPET DNA Isolation Kit能在FFPET样本中抽提获得高质量DNA,适用于CGH芯片分析,二代测序等对核酸模板质量要求高的下游应用。
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图3:从样品中抽提获得高质量DNA,提高qPCR检测灵敏度作为qPCR实验中的核酸模板,要求高质量DNA,即良好的核酸得率、纯度和片段大小分布,并能高灵敏度和不偏倚地检测到目标基因。取5ul DNA洗脱液,分别通过LightCycler 480 Real-Time PCR Instrument扩增检测CycA(442bp)或myo(89bp)基因片段。 结果:High Pure FFPET DNA Isolation Kit抽提获得的DNA样品能在qPCR研究中获得更高的检测灵敏度(提前出线的Cq值)。 |
图4:将DNA应用于甲基化敏感性高分辨率熔解曲线分析(MS-HRM)等前沿应用
将不同肿瘤研究样本的DNA抽提物经重亚硫酸盐处理,通过LightCycler 480 Instrument进行APC基因的MS-HRM分析,不同肿瘤组织的APC基因具有不同程度的甲基化。
结果:使用High Pure FFPET DNA Isolation Kit抽提获得的DNA是MS-HRM分析的理想模板。在该研究中,共发现3中不同程度的甲基化范围:样本A的APC甲基化水平在10-100%,样本B的甲基化水平在0-1%,样本C的APC不存在甲基化。
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产品信息
产品
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目录号
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包装规格
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High Pure FFPET DNA Isolation Kit
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06 650 767 001
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50次抽提反应
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